La RNPS es administrada por el Servicio Nacional de Áreas Naturales Protegidas, cual es la máxima autoridad y administrador de todas las ANP del Sistema Nacional de Áreas Naturales Protegidas por el Estado. La reserva protege la mayor extensión de bosque inundable en la Amazonía Peruana y ofrece una riqueza de recursos a la población humana presente en el área y su zona de amortiguamiento. Dentro y alrededor de la RNPS están apostadas varias comunidades cuya dinámica económica depende de los recursos naturales que existen en la reserva, estas comunidades ejercen una fuerte presión sobre estos recursos.